Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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