Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn6Q9Z262 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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