Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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