Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Vax2Q9WTP9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Vax2Q9WTP9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Vax2Q9WTP9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Vax2Q9WTP9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vax2Q9WTP9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Vax2Q9WTP9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Vax2Q9WTP9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Vax2Q9WTP9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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