Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AmfrQ9R049 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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AmfrQ9R049 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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AmfrQ9R049 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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AmfrQ9R049 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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AmfrQ9R049 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AmfrQ9R049 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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AmfrQ9R049 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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