Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Col4a4Q9QZR9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms