Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tcea2Q9QVN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms