Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms