Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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