Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms