Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms