Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rb1cc1Q9ESK9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms