Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnft1Q9DCN7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms