Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf6Q9DBU5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnf6Q9DBU5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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