Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Subh2bvQ9D9Z7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms