Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gtf3c6Q9D8P7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c6Q9D8P7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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