Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fip1l1Q9D824 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms