Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9bQ9D6E4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9bQ9D6E4 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc9bQ9D6E4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc9bQ9D6E4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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