Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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PrameQ9D4Z5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PrameQ9D4Z5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PrameQ9D4Z5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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