Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snx29Q9D3S3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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