Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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