Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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