Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ssbp3Q9D032 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ssbp3Q9D032 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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