Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc47Q9D024 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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