Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms