Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sgo1Q9CXH7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Sgo1Q9CXH7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Sgo1Q9CXH7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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