Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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