Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9CWU4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms