Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rab5aQ9CQD1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms