Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkp2Q9CQ73 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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