Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nsmce3Q9CPR8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms