Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Prpf8Q99PV0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms