Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RetnQ99P87 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RetnQ99P87 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RetnQ99P87 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RetnQ99P87 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RetnQ99P87 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RetnQ99P87 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RetnQ99P87 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms