Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KarsQ99MN1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms