Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms