Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms