Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ciao1Q99KN2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ciao1Q99KN2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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