Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Med28Q920D3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Med28Q920D3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms