Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SelenomQ8VHC3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms