Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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