Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE2

Gpn1, GPN-loop GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn1Q8VCE2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpn1Q8VCE2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gpn1Q8VCE2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms