Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

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Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ncapd2Q8K2Z4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ncapd2Q8K2Z4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ncapd2Q8K2Z4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ncapd2Q8K2Z4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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