Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Klf17Q8CFA7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms