Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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