Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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