Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spef2Q8C9J3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms