Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccser1Q8C0C4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccser1Q8C0C4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms