Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ctdsp2Q8BX07 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ctdsp2Q8BX07 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms