Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx17Q8BVL3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx17Q8BVL3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx17Q8BVL3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx17Q8BVL3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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