Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Nop53Q8BK35 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms